Di tahun 2010 M, Badai Hebat yang muncul bersamaan di seluruh dunia menyebabkan kerusakan parah. Lima miliar orang kehilangan nyawa, mengurangi populasi dunia menjadi 3 miliar. Ekonomi dan militer yang ada dimusnahkan. Negara-negara dibekukan di bawah es padat, dataran tenggelam di bawah laut, dunia berubah secara dramatis.

Peradaban manusia memasuki era yang kacau balau. Kemiskinan berkembang di luar zona ekonomi ini dan daerah kumuh tersebar luas. Kelas penguasa menyebut diri mereka Logos dan mempertahankan posisi mereka dengan kekuatan senjata. Mereka menyebut orang miskin Revenus, yang diasingkan untuk tinggal di luar kawasan ekonomi khusus.

Waktu telah berlalu sejak itu. Katsuragi Jo dan Tsurasawa Jin, melarikan diri dari Phantom, sebuah pasukan yang diorganisir untuk mengawasi Revenus dan untuk menekan elemen-elemen pemberontak dari Logos, membawa serta seorang gadis misterius, Nobuto Sana. Ada banyak yang tertarik padanya, semua dengan alasannya masing-masing.